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Museo Gregoriano Etrusco
Antiquarium romanum
Colección de jarrones
Museos de Antigüedades Clásicas
Museo Pío-Clementino
Museo Chiaramonti
Brazo Nuevo
Museo Gregoriano Profano
Museo Pío Cristiano (con lápidas cristianas y judías)
Pinacoteca
Tapices
Cerámica (S.IX - XVIII)
Micromosaicos
Colección de Arte Religioso Moderno
Museo Misionero-Etnológico
Museo Sacro
Museo Histórico Vaticano (Palacio Apostólico Lateranense)

Palacios Pontifícios(lugares incluidos en la visita de los Museos Vaticanos)
Palacete del Belvedere (Museo Pío-Clementino)
Galerías superiores (Sala de la Biga, Galerías de los Candelabros, Tapices y Mapas)
Apartamento de San Pío V
Sala de las Damas
Sala de la Inmaculada
Estancias de Rafael
Sala de los Claroscuros
Capilla Nicolina
Capilla de Urbano VIII
Capilla Sixtina
Apartamento Borgia
Salón Sixtino
Sala de las Bodas Aldobrandini
Galerías inferiores (Galería de Urbano VIII, Sala Alejandrina, Galería Clementina)