La actividad del Departamento se centra en la protección, conservación y puesta en valor de este patrimonio arquitectónico, en estrecha sinergia con la Dirección y con los demás Departamentos y Laboratorios de los Museos Vaticanos, la Dirección de Infraestructuras y las demás Administraciones del Estado.

A través del trabajo de campo —herramienta fundamental para comprobar el estado de conservación de los bienes e identificar posibles intervenciones necesarias— se llevan a cabo actividades como inspecciones técnicas, levantamientos y redacción de diversos proyectos.
Asimismo, el Departamento se ocupa de la investigación científica en apoyo de las restauraciones emprendidas y de la catalogación de los inmuebles, con el fin de profundizar en el conocimiento del patrimonio vaticano.
A estas actividades se suma la participación en congresos, publicaciones, organización de conferencias y jornadas de estudio.
Actualmente, el personal del Departamento está compuesto por dos arquitectos y un geoquímico.