Las actividades del Departamento de antigüedades griegas y romanas se concentran principalmente en el estudio y la conservación de las obras y de los yacimientos arqueológicos a los que pertenecen.

El mayor trabajo consiste en la dirección científica de las restauraciones y de los montajes museísticos. Estos cometidos prevén el estudio de la documentación histórica y bibliográfica, necesaria y preliminar a la investigación científica. Del mismo modo, resulta imprescindible el trabajo de actualización, tanto dirigido a los estudios como a la didáctica y a las nuevas tecnologías que puedan permitir la renovación y la valorización de los sectores expositivos, a menudo con nuevos montajes y nuevas instalaciones. A estas actividades se añade la necesaria divulgación científica de los resultados alcanzados en los varios ámbitos de investigación, con la participación en seminarios y congresos, y mediante la organización de conferencias y jornadas de estudio en los Museos Vaticanos. Asimismo, es importante la organización de exposiciones y la realización de nuevos soportes didácticos, que puedan dialogar con un público con exigencias muy diferentes.

La naturaleza de las colecciones escultóricas —que por calidad y cantidad se configuran entre las más relevantes en el campo de las antigüedades clásicas— conlleva relaciones frecuentes con la comunidad científica. Una de las actividades principales, en efecto, es la recogida y la elaboración de datos útiles para completar las investigaciones de otros estudiosos; en el ámbito de este diálogo libre y lleno de matices con frecuencia se desarrollan nuevas e inéditas ideas de investigación. Se sigue manteniendo con algunos institutos culturales la tradición de realizar estudios compartidos, que se concreta entre otras cosas en la producción de series editoriales con la participación de expertos autorizados en sectores específicos de la materia de estudio.

Es actividad ordinaria el cuidado de las colecciones, que consiste en el estudio y la catalogación, la actualización de los dosiers de las obras, referida primero en la ficha de inventario y luego en el catálogo online. En las zonas arqueológicas, en cambio, es necesario un control constante de los edificios y los restos, planificando su mantenimiento y restauración, también con el fin de mejorar los recorridos de visita.