El Departamento de antigüedades etrusco-itálicas desempeña una actividad de investigación que se centra esencialmente en las obras y los sectores museísticos de su competencia, con fines de estudio, conservación y valoración.
Para ello lleva a cabo campañas de catalogación y documentación fotográfica y gráfica, investigaciones de archivo e investigaciones bibliográficas. Las restauraciones —que promueve y dirige— además de tener como objetivo la conservación y una mejor fruición estética de la obra tanto por parte del visitante como del estudioso, constituyen momentos insustituibles de ahondamiento crítico para su conocimiento: se estudian y documentan igualmente materiales, técnicas de realización, elementos del contexto arqueológico y restauraciones históricas.

Los resultados de las investigaciones se divulgan mediante monografías específicas, siguiendo una tradición consolidada. Entre estas primerea la serie de los Catálogos, a la que se defiere la edición sistemática de las colecciones declinada en los varios sectores temáticos, en constante incremento.
La publicación sobre la cerámica figurativa constituye la histórica serie de los Vasi antichi dipinti del Vaticano, fundada en los años Veinte del s. XX por Carlo Albizzati, pionero de los estudios sobre la ceramografía antigua.
A estas dos se añade la serie Documenti e Monografie, cuyo objeto son la historia plurisecular de las colecciones y de los estudios, con una referencia preferente a las fuentes de archivo, así como a ahondamientos temáticos.

Otros estudios, entre los que promueve el Departamento, se presentan en artículos, ensayos y contribuciones en periódicos, catálogos, actas de congresos.

El Departamento cuida las relaciones y el diálogo con la comunidad científica internacional, tanto con estudiosos como con instituciones, y contribuye al avance de la investigación compartiendo conocimientos, así como organizando y participando en encuentros de estudio y conferencias.
La investigación especializada constituye la base de conocimiento tanto para la gestión diaria de las colecciones como para la comunicación al público del montaje museístico, que se sirve de un tradicional aparato didáctico y de un enfoque multimedia moderado.